Uloga elektroničkog upravljačkog sustava je osigurati da sustav opskrbe vodikom, sustav dovoda zraka i sustav upravljanja vodom i toplinom mogu raditi koordinirano i učinkovito kako bi mogli obavljati svoje optimalne performanse.

Uglavnom se sastoji od različitih senzora, mjerača protoka, komponenti ventila, upravljačke logike itd.

